BioWiki

5. 解析

入力について

検索結果から解析

4番目のタブの表をもとに「解析」ボタンで、集計結果をプロットにします。

以前のデータから解析

このタブの「書き出し」で出力したファイルを読み込んでもプロットを表示させることが出来ます。

出力について

ここでの結果を以下のフォーマットで出来ます。

  • 「xlsファイルに書き出し」によるファイル出力
  • 画像のコピー
  • 画像のファイル出力

表操作について

  • 列ヘッダをクリックすることで、セル内の値による並び替えができます。
  • 列ヘッダをドラッグすることで、列ごと入れ替えが出来ます。
    (左端の2列はそのままにしておいてください。)
  • セルをドラッグして選択すると、しきい値以下のセルの個数とパーセンテージを集計できます。

コンテキストメニューについて

<div class="right"> </div>

データを指定して選択

指定した条件で自動的に選択できます。不要な遺伝子やプローブをコピーしたり、削除する場合に便利です。

  • 閾値以上の列、未満の列を選択できます。
  • 閾値以上の行、未満の行を選択できます。
  • BLAST結果に現れなかった行や列も選択できます。

選択行・選択列の削除

選択範囲を含む列や行を削除できます。選択範囲が小さくても、列全体・行全体が削除されることに注意してください。

コピー

選択範囲の値をコピーします。カラムヘッダはコピーされません。

<div style="clear:both"></div>

しきい値について

スライダーバーで、E値の対数(-log10E)のしきい値を動かせます。動かした後に適用ボタンを押してください。また、色を変えたい場合は、色プロット左右の四角あるいはしきい値のテキストをクリックして色選択ダイアログを表示させてください。

画像プロットモードについて

「更新」ボタンを押すことで画像が更新されます。保存やコピーは、右クリックでコンテキストメニューを開いて行ってください。

配色モード

「2色」チェックボックスで切り替えます。 <div class="leftbox"> グラデーションモード

-log(E値)に応じて連続的に配色します。

</div><div class="leftbox"> 2色

-log(E値)のしきい値で2色に分けて表示します。

</div><div style="clear:both"></div>

検索から集計まで

リンク