BioWiki

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show_database_entries [2013/06/09 09:07] (現在)
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 +~~NOTOC~~
 +
 +
 +
 +<select Languages>​
 +bio:​show_database_entries|日本語
 +bio:​en:​show_database_entries|English
 +</​select>​
 +
 +====== データベースへのリンクの作り方 ======
 +このWiki内では、さまざまなデータベースのエントリへ簡単にリンクが張れるようになっています。(Interwiki機構)
 +
 +通常のリンクのように、%%[[(リンク)]]%%のように書きますが、リンクの部分にデータベースとIDを指定すると、データベースのエントリへのリンクが作成されます。
 +
 +<​code>​
 +[[データベース名>​ID]]
 +</​code>​
 +
 +
 +====NCBI====
 +^  データベース ​ ^  内容 ​ ^  ID  ^  書き方 ​ ^  実際の表示 ​ ^
 +^  PubMed ​ |Journals from PubMed ​ |  PMID  |  %%[[pubmed>​17803915]]%% ​ |  [[pubmed>​17803915]] ​ |
 +^Nucleotide ​ | ||||
 +^  Core|Nucleotide core  |  Gi  |  %%[[nuccore>​156766568]]%% ​ |  [[nuccore>​156766568]] ​ |
 +^  EST|EST ​ |  Gi  |  %%[[nucest>​161594556]]%% ​ |  [[nucest>​161594556]] ​ |
 +^  GSS|GSS ​ |  Gi  |  %%[[nucgss>​158853604]]%% ​ |  [[nucgss>​158853604]] ​ |
 +^  Protein ​ |Protein from Gi  |  Gi  |  %%[[protein>​156766569]]%% ​ |  [[protein>​156766569]] ​ |
 +^  Genome ​ |Genome map view  |  Taxon ID  |  %%[[genomemap>​420245]]%% ​ |  [[genomemap>​420245]] ​ |
 +^  MeSH  |Medical Subject Heading Terms| ​ MeSH ID  |  %%[[mesh>​68013012]]%% ​ |  [[mesh>​68013012]] ​ |
 +^  PubChem ​ |Chemical property ​ |  CID  |  %%[[pubchem>​5957]]%% ​ |  [[pubchem>​5957]] ​ |
 +^  Taxonomy ​ |Taxonomy lineage ​ |  TaxID  |  %%[[taxonomy>​10090]]%% ​ |  [[taxonomy>​10090]] ​ |
 +
 +====Gene====
 +
 +
 +====Protein====
 +^  データベース ​ ^  内容 ​ ^  ID  ^  書き方 ​ ^  実際の表示 ​ ^
 +^  PDB  |Structure database ​ |  PDB-ID ​ |  %%[[pdb>​2J4C]]%% ​ |  [[pdb>​2J4C]] ​ |
 +^  Enzyme ​ |Expasy enzyme ​ |  EC number ​ |  %%[[enzyme>​3.5.2.6]]%% ​ |  [[enzyme>​3.5.2.6]] ​ |
 +^  Brenda ​ |Comprehensive enzyme database ​ |  EC number ​ |  %%[[BrendaEC]]%% ​ |  [[BrendaEC>​3.5.2.6]] ​ |
 +^  Brenda ​ |Comprehensive enzyme database ​ |  Enzyme name  |  %%[[BrendaName>​lactamase]]%% ​ |  [[BrendaName>​lactamase]] ​ |
 +^  InterPro ​ |Protein family/​domain ​ |  IPRO accession ID  |  %%[[interpro>​IPR001466]]%% ​ |  [[interpro>​IPR001466]] ​ |
 +^  UniProt ​ |Universal protein knowledgebase ​ |  UniProt entry name  |  %%[[uniprot>​LACTB_HUMAN]]%% ​ |  [[uniprot>​LACTB_HUMAN]] ​ |
 +
 +====Products====
 +^  データベース ​ ^  内容 ​ ^  ID  ^  書き方 ​ ^  実際の表示 ​ ^
 +^  Merck products ​ |Products of Merck  |  ID  |  %%[[merck>​04-12-1065]]%% ​ |  [[merck>​04-12-1065]] ​ |
 +
 +
 +
 +{{tag>​書き方 DokuWiki データベース}}
 +
 +====== DokuWikiでのInterwiki ======
 +DokuWikiは、このリンク作成を簡単に実装できる[[sympluswiki>​interwiki]]という機構があり、**conf/​interwiki.conf**にURLを追加することでInterwikiを作成できる。
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